الأنهار هي مصادر المياه السطحية التي تتدفق نحو المحيط. وهي عمومًا أكبر من الجداول الصغيرة وهي في الغالب مصادر للمياه العذبة مع مجموعة من الملوثات. تعتمد الملوثات الموجودة في النهر على المواد التي يتدفق من خلالها النهر وكذلك على ما يعيش على ضفافه وعلى طوله.

الملوثان الرئيسيان في مياه النهر هما المواد الصلبة العالقة (والتي تختلف في تركيزها خلال العام) والتلوث الميكروبيولوجي. سيصبح النهر مالحًا عندما يقترب من المحيط، وبالتالي فإن تقنيات المعالجة المطلوبة ستعتمد على مدى بعد مياه النهر عن المحيط. تقع المدن الكبرى والصناعات الاستخراجية عادة على ضفاف الأنهار، لذلك يمكن أن يكون التلوث الصناعي أيضًا مصدرًا ملوثًا للقلق. طرق المعالجة الأكثر شيوعًا لمياه النهر هي التنقية والتطهير بالأشعة فوق البنفسجية.

تمتلك شركة Moerk Water عددًا من المنشآت التي تعالج مياه الأنهار حول العالم